Seguindo directivas emanadas pela Fundação para a Ciência e a Tecnologia, as actividades de investigação do CHAM encontram-se subdivididas em nove grandes áreas temáticas, cada uma delas sob a responsabilidade de um investigador doutorado. Dentro destas linhas integram-se as diversas acções desenvolvidas pelo CHAM e as acções individuais dos investigadores.

Linhas de Investigação 2010-2013

Antiguidade e as suas Percepções na Época Moderna
Coordenador: Francisco Caramelo

Arqueologia Moderna e da Expansão Portuguesa
Coordenador: André Teixeira

As Artes e a Expansão Portuguesa
Coordenador: Nuno Senos

Configurações Políticas e Institucionais do Império Português
Coordenador: Tiago C. P. dos Reis Miranda

Dimensões Religiosas da Expansão Portuguesa
Coordenadora: Susana Goulart Costa

Dinâmicas e contextos do Colonialismo na Época Contemporânea
Coordenadora: Susana Serpa Silva

Economias Ultramarinas e Redes Comerciais
Coordenadora: Margarida Vaz do Rego Machado

Grupos e Representações Sociais na Expansão Portuguesa
Coordenadora: Roberta Stumpf

Intercâmbios Culturais e Globalização
Coordenadora: Ana Paula Avelar

Centro de História de Além-Mar - FCSH-Universidade Nova de Lisboa / Universidade dos Açores